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2020-06-28 17:03:03
来源：科技日报微信公众号
作者：王诗尧
责任编辑：王诗尧
2020年06月28日 17:03 来源：科技日报微信公众号参与互动
◎ 科技日报记者 李丽云
始发于新发地这轮北京疫情牵动人心
6月26日中国疾病预防控制中心公布“6月北京新型冠状病1肺炎疫情进展”这份疫情专报在病1来源分析中指出从2例男性病例和北京新发地批发市场环境采集标本中获得3株病1基因分析显示北京本次疫情流行新冠病1为L基因型欧洲家系分支Ⅰ该1株比当前欧洲流行同型1株更“老”；可以排除由动物病1外溢传染人也排除今年4月前北京本地传播1株或武汉流行1株导致本次疫情
疫情在新发地批发市场传染模式推测主要为人与人之间直接接触传播或经物品表面污染间接接触传播
这份疫情专报对北京本轮疫情趋势研判认为：在北京已经加强监测和强力扩大社交距离防控措施下疫情进步传播风险低北京疫情近期有望得到控制
判断为欧洲输入依据什么？
关键标本来自哪里？
专报中说北京本次流行1株比当前欧洲流行同型1株更“老”这意味着什么？依据什么判断新发地1株为欧洲输入来源？
6月27日科技日报记者采访中国疾病预防控制中心病1病预防控制所党委书记、中国疾病预防控制中心生物安全首席专家武桂珍研究员
通过系统进化树、亚型分析和特定位点分析都支持北京新发地关联1株属于同个近缘病1亚型位点6026和28881-28883变异为北京新发地1株标志性变异组合变异位点6026出现频率特别低该变异疑似于3月初在欧洲形成但未见大规模传播(也可能未被测序)属于非主流传播病1株；28881-28883位点变异为境外输入型1株标志性突变首先报告于英国随后流行于欧美地区在我国本土病例中罕见“综上所述判断北京新发地1株为欧洲输入来源”武桂珍说
通过对含有特异性位点样本采集时间进行回溯同时带有这些特征性变异位点1株最早于2020年3月发现于境外输入病例样本中此后多发现于3月至4月期间流行1株因此判断该1株至少在2020年3月前产生因此说新发地流行病1比现在欧洲流行病1要“老”
“这其中涉及好几种可能性”病1有可能会在新发地批发市场等阴暗潮湿环境潜伏下来导致进化速度变慢在适宜时机再次感染人由感染新冠病1患者或阳性感染者排泄物污染海鲜市场环境间接感染导致暴发疫情；另外病1可能潜伏在进口冷冻食品当中未拆包装冷冻生鲜产品在境外被新冠病1感染者偶然污染在从境外到境内整个存储、运输期间病1由于被冷冻没有发生进化所以它会发生变异“最终我们看到就这些1株更接近于流行于欧洲老病1”
“精准”捉元凶背后
高科技监测和朔源体系
“在新冠病1病原体鉴定和溯源中基于新冠病1全基因组分子分型方法发挥重要作用”武桂珍说
生物安全攸关民众健康、社会1和国家战略安全传染病病原体基因组序列事关国家生物安全重要战略资源中国疾病预防控制中心病1病所张勇研究员介绍在国家科技重大专项资助下病1病所正在牵头在全国筹建基于病1全基因组病1网络化监测和溯源技术体系以应对病1溯源这个关系到国家安全病1病预防控制重大问题
当前随着基因组学技术和生物信息学以及大数据管理技术迅速发展新代基因组测序技术可以对标本中致病微生物实现更加详细分析通过生物信息学分析和大型服务器高速运算对海量全基因组序列数据进行加工整理可以准确进行病1溯源洞悉病原体进化过程发现其1力和致病因子、耐药基因从而把握病原体致病和耐药机制为病1病“精准防控”提供理论依据
病原体基因组学领域保持着持续较快发展态势各种分子技术正在被整合进入病1性传染病诊断和预防控制之中将基因组技术与生物信息学和流行病学有机整合起来改善传染病公共卫生监测、研究和控制同时也在全球范围内发挥越来越大作用例如2003年SARS病1溯源分析2011年中国新疆输入性脊灰野病1传播溯源分析中在2014-2016年西非地区埃博拉病1流行病传播溯源中都得到广泛应用
在国家科技重大专项资助下病1病所牵头建立整套基于新冠病1基因组分型与聚集分析算法等监测、溯源技术体系可用于病1性传染病预警预测应用部门包括我国各级疾病预防控制中心以及科研、医院等系统将极大地提高我国本土病1性传染病预防控制能力为我国重大传染病防控和生物安全体系建设发挥重要作用
转战半个中国抗疫英雄团队
在北京家门口再出征
自2019年12月31日凌晨接到任务开始中国疾病预防控制中心病1病所科研团队跨越半个中国从湖北武汉到黑龙江绥芬河、牡丹江、哈尔滨再到吉林舒兰这支科研队伍持续奋战数月冲锋在这场抗疫战争最前沿每到地他们都快速建起移动生物安全实验室快速进入战斗状态
北京新发地疫情暴发后武桂珍研究员带领团队在家门口再次出征他们快速组成新型冠状病1感染溯源工作组第时间紧急来到新发地农产品批发市场在市场内部进行溯源调查和采集样本6月14至15日两天时间就采集近千份样本并立即进行新型冠状病1核酸检测
据专报公布疫情发生后北京市迅速扩增实验室检测能力7000多名工作人员轮班上岗2000多个采样点位全负荷运行截至2020年6月22日北京市具备核酸检测能力机构已达128所同时国家卫生健康委协调全国12个省20支核酸检测队支援北京调配移动P3实验室动员增加实验室建设同时协调天津、河北分担北京部分检测任务为北京应检尽检提供重要支撑